Upgrade von kitkat auf marshmallow - wie sinnvoll Backup machen?

Wenn das Phone nicht gerootet ist, sind die Möglichkeiten etwas beschränkt.
Mit "Helium - App Sync and Backup" kommt man aber schon ziemlich weit. Mehr geht meines Wissens ungerootet nicht. Musst dich damit mal vorher beschäftigen.

Wenn du das 6er dann doof findest, hast du Pech gehabt. Der Rückweg ist je nach Phone mehr oder weniger aufwändig.

Wenn das OTA normal durchläuft, sollte mit den Daten eigentlich nichts passieren. Aber eine Sicherung in irgendeiner Form ist immer gut.

Zurück zu Kitkat würde beim Nexus 5 bedeuten, dass der Bootloader geöffnet werden muss - dabei wird alles gelöscht. Dann installiert man das gewünschte Factory Image. Mit rooten hat das nichts zu tun.

Nach so einem großen Update würde ich aber trotzdem einen Factory Reset einplanen, falls sich irgendwas komisch verhält.

Also nach einem Versionsprung alte Daten zurücksichern ist nicht klug, das ist eine Fehlerquelle. Update machen, zurücksetzen und sauber neu einrichten, dann hast Du ein sauberes, fehlerfreies System.

Klar kann man normale App-Daten zurückspielen. Wüsste nicht, warum man das nicht machen sollte.
Bei Systemdaten läßt man das lieber, das stimmt. Aber das betrifft eher (System)Sicherungen, die man mit Titanium Backup gemacht hat. Das ist hier ja nicht der Fall.

Ich würde erst mal das OTA machen und dann ausprobieren. In der Regel ist ja alles Ok.